美国FBI探员福克斯·穆德（大卫·杜楚尼 David Duchovny 饰）童年时曾经历一起离奇神秘的绑架案他的妹妹萨曼莎在睡梦中被外星人劫持至今下落不明从此穆德便专注于神秘事件的研究并专门负责FBI总部的X档案部门因穆德行事乖张难以驾驭FBI高层从联邦调查局学院调来女性探员黛娜·斯科莉（吉莲·安德森 Gillian Anderson 饰）表面上是协助穆德工作实际上是希望这名崇尚科学的理性探员能够制约穆德的行为两人最初的合作并不理想完全不同的思维模式时刻导致争论的爆发但随着各种离奇案件的出现以及两人交往的加深穆德和斯科莉最终变成可以为对方出生入死的可靠伙伴…… 　　本片荣获1996~1999年度美国作曲家、作家及出版商协会影视音乐奖电视剧集第一名以及其他电影节近70个奖项