1937年日军入侵南京战火中六朝古都化为废墟众多中国军民被困城中一支十数人的国军德械教导队余部在长官李教官（佟大为 饰）指挥下从日军手中救出了一批教会学校女学生而李教官等人至此丧失了出城的机会幸免于难的书娟（张歆怡 饰）等学生返回文彻斯特教堂随她们一 起来到的还有受雇远道至此收敛神父遗体的美国人约翰·米勒（克里斯蒂安·贝尔 Christian Bale 饰）此时的南京城中逃难的人们蜂拥进安全区和教堂寻找庇护十四名风尘女子强行进入教堂避难其中精通英语的玉墨（倪妮 饰）希望借助约翰的身份为一行人提供更多保护教堂的墙壁并不能阻挡日军的铁蹄教堂内的人们将面临孰生孰死的选择……